ANOVA君 をテンプレートにして作成 - 井関龍太のページ
井関龍太のページ
ANOVA君
をテンプレートにして作成
開始行:
*&color(#6A5ACD){ANOVA君とは}; [#z8006c7d]
フリーの統計ソフトウェア「[[R>http://www.r-project.org/]]...
-被験者間要因(独立測度),被験者内要因(反復測度)のいず...
-単純主効果の検定を行います(一次の交互作用についてのみ)
-多重比較を行います(修正Bonferroniの方法による)
-非釣り合い型計画(unbalanced design)に対応しています(...
-球面性検定と自由度調整を行います
R上で[[js-STAR>http://www.kisnet.or.jp/nappa/software/sta...
**&color(#000080){ANOVA君のファイル}; [#w8e0cbdd]
下のアイコンをクリックしてファイルを保存してください。
保存用のポップアップが表示されない場合は,右クリックして“...
&ref(anovakun_489.txt);
【[[リリースノート>ANOVA君/リリースノート]]】
2023-05-01 anovakun version 4.8.9公開
-[[ANOVA君の使い方>ANOVA君/ANOVA君の使い方]]
-[[ANOVA君の特徴>ANOVA君/ANOVA君の特徴]]
-[[平方和のタイプ>ANOVA君/平方和のタイプ]]
-[[球面性検定の出力>ANOVA君/球面性検定の出力]]
-[[多標本球面性への対応>ANOVA君/多標本球面性への対応]]
-[[多重比較の方法>ANOVA君/多重比較の方法]]
-[[Shafferの方法のバリエーション>ANOVA君/Shafferの方法の...
-[[反復測定デザインにおける効果量>ANOVA君/反復測定デザイ...
-[[反復測定デザインにおける信頼区間>ANOVA君/反復測定デザ...
-[[FAQ>ANOVA君/FAQ]]
*&color(#6A5ACD){ANOVA君の出力例}; [#x16851f1]
以下のデータにdatという名前をつけて読み込んだ場合の出力例...
# データ(AsBデザイン-2水準の被験者間要因1つ,3水準...
a1 4 7 5
a1 6 3 6
a1 8 6 4
a1 7 8 3
a2 4 8 9
a2 2 2 8
a2 1 3 8
a2 5 4 7
a2 4 5 9
a2 2 3 7
&size(12){※上の囲みにサイドバーが表示される場合は,ブラウ...
データを読み込んだ後に,以下のような簡単なコードを入力す...
> anovakun(dat, "AsB", 2, 3)
記述統計量,球面性の指標,分散分析表,下位検定の結果(こ...
[ AsB-Type Design ]
This output was generated by anovakun 4.8.9 under R vers...
It was executed on Mon May 1 10:19:04 2023.
<< DESCRIPTIVE STATISTICS >>
------------------------------
A B n Mean S.D.
------------------------------
a1 b1 4 6.2500 1.7078
a1 b2 4 6.0000 2.1602
a1 b3 4 4.5000 1.2910
a2 b1 6 3.0000 1.5492
a2 b2 6 4.1667 2.1370
a2 b3 6 8.0000 0.8944
------------------------------
<< SPHERICITY INDICES >>
== Mendoza's Multisample Sphericity Test and Epsilons ==
--------------------------------------------------------...
Effect Lambda approx.Chi df p LB GG...
--------------------------------------------------------...
B 0.2238 2.3148 5 0.8041 ns 0.5000 0.9621...
--------------------------------------------------------...
LB = lower.bound, GG = Gre...
HF = Huynh-Feldt-Lecoutre, ...
<< ANOVA TABLE >>
== This data is UNBALANCED!! ==
== Type III SS is applied. ==
--------------------------------------------------------...
Source SS df MS F-ratio p-value
--------------------------------------------------------...
A 2.0056 1 2.0056 0.6048 0.4591 ns
s x A 26.5278 8 3.3160
--------------------------------------------------------...
B 13.4778 2 6.7389 2.6918 0.0982 +
A x B 60.8111 2 30.4056 12.1454 0.0006 ***
s x A x B 40.0556 16 2.5035
--------------------------------------------------------...
Total 157.8667 29 5.4437
+p < .10, *p < .05, **p < .01, ***p < .001
<< POST ANALYSES >>
< MULTIPLE COMPARISON for "B" >
== Shaffer's Modified Sequentially Rejective Bonferroni ...
== The factor < B > is analysed as dependent means. ==
== Alpha level is 0.05. ==
--------------------------
B n Mean S.D.
--------------------------
b1 10 4.6250 2.2632
b2 10 5.0833 2.2336
b3 10 6.2500 2.0656
--------------------------
----------------------------------------------------------
Pair Diff t-value df p adj.p
----------------------------------------------------------
b1-b3 -1.6250 2.4158 8 0.0421 0.1264 b1 = b3
b2-b3 -1.1667 1.4783 8 0.1776 0.1776 b2 = b3
b1-b2 -0.4583 0.6552 8 0.5307 0.5307 b1 = b2
----------------------------------------------------------
< SIMPLE EFFECTS for "A x B" INTERACTION >
--------------------------------------------------------...
Effect Lambda approx.Chi df p LB G...
--------------------------------------------------------...
B at a1 0.8702 0.1854 2 0.9114 ns 0.5000 0.918...
B at a2 0.9964 0.0058 2 0.9971 ns 0.5000 0.998...
--------------------------------------------------------...
LB = lower.bound, GG = Gr...
HF = Huynh-Feldt-Lecoutre,...
--------------------------------------------------------...
Source SS df MS F-ratio p-value
--------------------------------------------------------...
A at b1 25.3500 1 25.3500 9.7735 0.0141 *
Er at b1 20.7500 8 2.5938
--------------------------------------------------------...
A at b2 8.0667 1 8.0667 1.7520 0.2222 ns
Er at b2 36.8333 8 4.6042
--------------------------------------------------------...
A at b3 29.4000 1 29.4000 26.1333 0.0009 ***
Er at b3 9.0000 8 1.1250
--------------------------------------------------------...
B at a1 7.1667 2 3.5833 0.8431 0.4757 ns
s x B at a1 25.5000 6 4.2500
--------------------------------------------------------...
B at a2 82.1111 2 41.0556 28.2061 0.0001 ***
s x B at a2 14.5556 10 1.4556
--------------------------------------------------------...
+p < .10, *p < .05, **p < .01, ***p < .001
< MULTIPLE COMPARISON for "B at a2" >
== Shaffer's Modified Sequentially Rejective Bonferroni ...
== The factor < B at a2 > is analysed as dependent means...
== Alpha level is 0.05. ==
----------------------------------------------------------
Pair Diff t-value df p adj.p
----------------------------------------------------------
b1-b3 -5.0000 7.3193 5 0.0007 0.0022 b1 < b3 *
b2-b3 -3.8333 5.4515 5 0.0028 0.0028 b2 < b3 *
b1-b2 -1.1667 1.6592 5 0.1580 0.1580 b1 = b2
----------------------------------------------------------
output is over --------------------///
*&color(#6A5ACD){使用条件}; [#bc4ca0d9]
-anovakunとこれを構成する関数(コード群)は,自由に使用,...
-ただし,改変を加えたものを公開する際には,改変を加えたこ...
-anovakunとこれを構成する関数(コード群)の使用によって生...
*&color(#6A5ACD){問題点}; [#h34d3a9f]
計算速度が遅いです。
高次の要因計画でデータ数や要求される計算の回数が多いと遅...
そのような場合には,よりスペックの高いマシン(特に,メモ...
または,水準数が多い場合には,多重比較としてHolmの方法を...
**&color(#000080){更新状況}; [#dd46be3a]
-2つ以上の要因を含む計画で,多重比較の結果が適切でない(...
--version 2.0.0では,この問題を解決しました(2007-10-01)
--この問題の詳細については,[[複数の要因がある計画におけ...
-[[高速化の試み>ANOVA君/高速化の試み]](2008-02-01; versi...
-被験者間計画の分析で,出力の表示にエラーが起こることがあ...
--R 2.9.2以降のバージョンでANOVA君を使用している場合に,...
--この問題は,オプションとしてtech = Tを指定することで回...
--version 4.1.1では,この問題を解決しました(2010-01-04)
-オメガ二乗系の効果量(ω&SUP{2};,ω&SUB{p};&SUP{2};,ω&SU...
--version 4.2.0の計算方法では,被験者間計画以外では適切な...
--version 4.3.0では,この問題に対応しました(2012-07-02)
--この問題の詳細については,[[オメガ二乗の複雑な事情>ANOV...
-正規化に基づく信頼区間の計算が適切でないことがある(2014...
--version 4.5.0では,被験者間要因を2つ以上含む混合要因計...
--version 4.5.1では,この問題を解決しました(2014-03-03)
※不具合,バグなど見つかりましたら,井関までお知らせいただ...
終了行:
*&color(#6A5ACD){ANOVA君とは}; [#z8006c7d]
フリーの統計ソフトウェア「[[R>http://www.r-project.org/]]...
-被験者間要因(独立測度),被験者内要因(反復測度)のいず...
-単純主効果の検定を行います(一次の交互作用についてのみ)
-多重比較を行います(修正Bonferroniの方法による)
-非釣り合い型計画(unbalanced design)に対応しています(...
-球面性検定と自由度調整を行います
R上で[[js-STAR>http://www.kisnet.or.jp/nappa/software/sta...
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&ref(anovakun_489.txt);
【[[リリースノート>ANOVA君/リリースノート]]】
2023-05-01 anovakun version 4.8.9公開
-[[ANOVA君の使い方>ANOVA君/ANOVA君の使い方]]
-[[ANOVA君の特徴>ANOVA君/ANOVA君の特徴]]
-[[平方和のタイプ>ANOVA君/平方和のタイプ]]
-[[球面性検定の出力>ANOVA君/球面性検定の出力]]
-[[多標本球面性への対応>ANOVA君/多標本球面性への対応]]
-[[多重比較の方法>ANOVA君/多重比較の方法]]
-[[Shafferの方法のバリエーション>ANOVA君/Shafferの方法の...
-[[反復測定デザインにおける効果量>ANOVA君/反復測定デザイ...
-[[反復測定デザインにおける信頼区間>ANOVA君/反復測定デザ...
-[[FAQ>ANOVA君/FAQ]]
*&color(#6A5ACD){ANOVA君の出力例}; [#x16851f1]
以下のデータにdatという名前をつけて読み込んだ場合の出力例...
# データ(AsBデザイン-2水準の被験者間要因1つ,3水準...
a1 4 7 5
a1 6 3 6
a1 8 6 4
a1 7 8 3
a2 4 8 9
a2 2 2 8
a2 1 3 8
a2 5 4 7
a2 4 5 9
a2 2 3 7
&size(12){※上の囲みにサイドバーが表示される場合は,ブラウ...
データを読み込んだ後に,以下のような簡単なコードを入力す...
> anovakun(dat, "AsB", 2, 3)
記述統計量,球面性の指標,分散分析表,下位検定の結果(こ...
[ AsB-Type Design ]
This output was generated by anovakun 4.8.9 under R vers...
It was executed on Mon May 1 10:19:04 2023.
<< DESCRIPTIVE STATISTICS >>
------------------------------
A B n Mean S.D.
------------------------------
a1 b1 4 6.2500 1.7078
a1 b2 4 6.0000 2.1602
a1 b3 4 4.5000 1.2910
a2 b1 6 3.0000 1.5492
a2 b2 6 4.1667 2.1370
a2 b3 6 8.0000 0.8944
------------------------------
<< SPHERICITY INDICES >>
== Mendoza's Multisample Sphericity Test and Epsilons ==
--------------------------------------------------------...
Effect Lambda approx.Chi df p LB GG...
--------------------------------------------------------...
B 0.2238 2.3148 5 0.8041 ns 0.5000 0.9621...
--------------------------------------------------------...
LB = lower.bound, GG = Gre...
HF = Huynh-Feldt-Lecoutre, ...
<< ANOVA TABLE >>
== This data is UNBALANCED!! ==
== Type III SS is applied. ==
--------------------------------------------------------...
Source SS df MS F-ratio p-value
--------------------------------------------------------...
A 2.0056 1 2.0056 0.6048 0.4591 ns
s x A 26.5278 8 3.3160
--------------------------------------------------------...
B 13.4778 2 6.7389 2.6918 0.0982 +
A x B 60.8111 2 30.4056 12.1454 0.0006 ***
s x A x B 40.0556 16 2.5035
--------------------------------------------------------...
Total 157.8667 29 5.4437
+p < .10, *p < .05, **p < .01, ***p < .001
<< POST ANALYSES >>
< MULTIPLE COMPARISON for "B" >
== Shaffer's Modified Sequentially Rejective Bonferroni ...
== The factor < B > is analysed as dependent means. ==
== Alpha level is 0.05. ==
--------------------------
B n Mean S.D.
--------------------------
b1 10 4.6250 2.2632
b2 10 5.0833 2.2336
b3 10 6.2500 2.0656
--------------------------
----------------------------------------------------------
Pair Diff t-value df p adj.p
----------------------------------------------------------
b1-b3 -1.6250 2.4158 8 0.0421 0.1264 b1 = b3
b2-b3 -1.1667 1.4783 8 0.1776 0.1776 b2 = b3
b1-b2 -0.4583 0.6552 8 0.5307 0.5307 b1 = b2
----------------------------------------------------------
< SIMPLE EFFECTS for "A x B" INTERACTION >
--------------------------------------------------------...
Effect Lambda approx.Chi df p LB G...
--------------------------------------------------------...
B at a1 0.8702 0.1854 2 0.9114 ns 0.5000 0.918...
B at a2 0.9964 0.0058 2 0.9971 ns 0.5000 0.998...
--------------------------------------------------------...
LB = lower.bound, GG = Gr...
HF = Huynh-Feldt-Lecoutre,...
--------------------------------------------------------...
Source SS df MS F-ratio p-value
--------------------------------------------------------...
A at b1 25.3500 1 25.3500 9.7735 0.0141 *
Er at b1 20.7500 8 2.5938
--------------------------------------------------------...
A at b2 8.0667 1 8.0667 1.7520 0.2222 ns
Er at b2 36.8333 8 4.6042
--------------------------------------------------------...
A at b3 29.4000 1 29.4000 26.1333 0.0009 ***
Er at b3 9.0000 8 1.1250
--------------------------------------------------------...
B at a1 7.1667 2 3.5833 0.8431 0.4757 ns
s x B at a1 25.5000 6 4.2500
--------------------------------------------------------...
B at a2 82.1111 2 41.0556 28.2061 0.0001 ***
s x B at a2 14.5556 10 1.4556
--------------------------------------------------------...
+p < .10, *p < .05, **p < .01, ***p < .001
< MULTIPLE COMPARISON for "B at a2" >
== Shaffer's Modified Sequentially Rejective Bonferroni ...
== The factor < B at a2 > is analysed as dependent means...
== Alpha level is 0.05. ==
----------------------------------------------------------
Pair Diff t-value df p adj.p
----------------------------------------------------------
b1-b3 -5.0000 7.3193 5 0.0007 0.0022 b1 < b3 *
b2-b3 -3.8333 5.4515 5 0.0028 0.0028 b2 < b3 *
b1-b2 -1.1667 1.6592 5 0.1580 0.1580 b1 = b2
----------------------------------------------------------
output is over --------------------///
*&color(#6A5ACD){使用条件}; [#bc4ca0d9]
-anovakunとこれを構成する関数(コード群)は,自由に使用,...
-ただし,改変を加えたものを公開する際には,改変を加えたこ...
-anovakunとこれを構成する関数(コード群)の使用によって生...
*&color(#6A5ACD){問題点}; [#h34d3a9f]
計算速度が遅いです。
高次の要因計画でデータ数や要求される計算の回数が多いと遅...
そのような場合には,よりスペックの高いマシン(特に,メモ...
または,水準数が多い場合には,多重比較としてHolmの方法を...
**&color(#000080){更新状況}; [#dd46be3a]
-2つ以上の要因を含む計画で,多重比較の結果が適切でない(...
--version 2.0.0では,この問題を解決しました(2007-10-01)
--この問題の詳細については,[[複数の要因がある計画におけ...
-[[高速化の試み>ANOVA君/高速化の試み]](2008-02-01; versi...
-被験者間計画の分析で,出力の表示にエラーが起こることがあ...
--R 2.9.2以降のバージョンでANOVA君を使用している場合に,...
--この問題は,オプションとしてtech = Tを指定することで回...
--version 4.1.1では,この問題を解決しました(2010-01-04)
-オメガ二乗系の効果量(ω&SUP{2};,ω&SUB{p};&SUP{2};,ω&SU...
--version 4.2.0の計算方法では,被験者間計画以外では適切な...
--version 4.3.0では,この問題に対応しました(2012-07-02)
--この問題の詳細については,[[オメガ二乗の複雑な事情>ANOV...
-正規化に基づく信頼区間の計算が適切でないことがある(2014...
--version 4.5.0では,被験者間要因を2つ以上含む混合要因計...
--version 4.5.1では,この問題を解決しました(2014-03-03)
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